Van alle soorten waterflessen zijn glazen waterflessen het gezondst en veiligst.
De eerste keuze voor drinkflessen zouden glazen waterflessen moeten zijn, vooral voor kantoor- en thuisgebruikers. Glas is niet alleen transparant, maar ook het gezondste en veiligste van alle materialen. Glazen waterflessen zijn gemaakt van anorganische silicaten, die geen organische chemicaliën bevatten tijdens het bakken. Wanneer mensen water of andere dranken drinken met een glazen waterfles, hoeven ze zich geen zorgen te maken dat de chemische stoffen in hun maag worden gedronken. Bovendien hebben glazen gladde oppervlakken en zijn ze gemakkelijk schoon te maken. Bacteriën en vuil nestelen zich niet gemakkelijk op de wand van glazen, dus water drinken met een glazen waterfles is het gezondste en veiligste.
Het enige om op te merken is dat glazen waterflessen het meest bang zijn voor thermische uitzetting en krimp. Glazen waterflessen die te koud zijn (zoals flessen die net uit de koelkast zijn gehaald en net van buiten de kou zijn gehaald) moeten niet direct met heet water worden gevuld om te voorkomen dat ze barsten.