بشكل عام، يكون غلي الماء في زجاجة ماء زجاجية أفضل من غليه في زجاجة ماء بلاستيكية. فزجاجات الماء الزجاجية مستقرة نسبيًا، في حين أن زجاجات الماء البلاستيكية تكون عرضة للرائحة عند ملء الماء المغلي بها.
لا تحتوي زجاجات المياه الزجاجية على مواد كيميائية عضوية أثناء عملية إطلاق النار. عندما يشرب الناس الماء أو المشروبات الأخرى باستخدام زجاجات المياه الزجاجية، لا داعي للقلق بشأن دخول المواد الكيميائية إلى معدتهم. علاوة على ذلك، فإن سطح الزجاج أملس وسهل التنظيف. ليس من السهل تكاثر البكتيريا والأوساخ على جدار الزجاج. ومع ذلك، يمكن شراء زجاجات المياه الزجاجية سميكة أو رقيقة جدًا، وبعضها بسبب مبدأ التمدد والانكماش الحراري، والزجاجة في حالة باردة نسبيًا، تُسكب فجأة في الماء المغلي، وقد تنفجر. تحتاج زجاجات المياه هذه إلى سكب القليل قبل صب الماء المغلي، بحيث يتم تسخين الزجاجة بالكامل مسبقًا، ثم تُسكب في الماء المغلي، لتقليل زجاجة الماء الزجاجية لأن الماء المغلي ينفجر.
لا تنفجر زجاجات المياه البلاستيكية بسهولة مثل زجاجات المياه الزجاجية عند سكبها في الماء الساخن. ولكن غالبًا ما يتم إضافة الملدنات إلى البلاستيك، والتي تحتوي على بعض المواد الكيميائية السامة. عند ملء الماء الساخن أو الماء المغلي في زجاجات المياه البلاستيكية، يتم تخفيف المواد الكيميائية السامة بسهولة في الماء، والبنية الدقيقة الداخلية للبلاستيك بها العديد من الثقوب، والتي تخفي الأوساخ، ويمكن للبكتيريا أن تتكاثر بسهولة إذا لم يتم تنظيفها بشكل صحيح. لذلك، عند اختيار زجاجة المياه البلاستيكية، من الضروري اختيار زجاجات المياه المصنوعة من البلاستيك الصالح للأكل والتي تلبي المعايير الوطنية. يوصى باستخدام زجاجات المياه البلاستيكية PP أو TRITAN.